Phos-tag SDS-PAGE データ集 ArcBA
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ArcB

Member of the two-component regulatory system ArcB/ArcA. Sensor-regulator protein for anaerobic repression of the arc modulon. Activates ArcA via a four-step phosphorelay. ArcB can also dephosphorylate ArcA by a reverse phosphorelay involving His-717 and Asp-576. Mw; 88,000

ArcA

Member of the two-component regulatory system ArcB/ArcA. Represses a wide variety of aerobic enzymes under anaerobic conditions. Controls the resistance of E.coli to dyes; required for expression of the alkaline phosphatase and sex factor F genes; It also may be involved in the osmoregulation of envelope proteins. When activated by ArcB, it negatively regulates the expression of genes of aerobic function. Activates the transcription of the plfB operon by binding to its promoter.w: 27,300

泳動結果

ArcBA

バクテリアの情報伝達経路には,ヒスチジンとアスパラギン酸によるリン酸基転移反応によって行われるものがあり,二成分伝達系と言われます。

外界の環境変化を捉えるセンサーキナーゼ(ヒスチジンキナーゼ)と
レスポンスレギュレータのペアから成ります。

センサーキナーゼのヒスチジンが自己リン酸化によってリン酸化し,
そのリン酸基がレスポンスレギュレータのアスパラギン酸に転移されます。
レスポンスレギュレータ〜は転写因子として支配下の遺伝子発現に関わります。

本実験は,E.coli の 二成分伝達系ArcB/ArcA のin vitro kinase assayです。
His-tagタンパク質として発現,精製したものです。

ArcB, ArcAのリン酸基転移が分子間転移か,分子内転移かを決定した実験です。

ArcBは, HKドメイン,レシーバードメイン,HPtドメインの3つのドメインからなり
HKドメインのH292
レシーバードメインのD576
HPtドメインのH717
へと,3段階のリン酸基転移リレーを行う「ハイブリッドヒスチジンキナーゼ」です。
HPtドメインから,レスポンスレギュレータのArcA D54 にリン酸基転移します。
二量体を形成しており,その転移反応は分子間あるいは分子内で起こると考えられます。

ArcBAscheme

「ArcB seif-phosphorylation」 はArcBがATP存在下で自己リン酸化する様子を
Mn2+–Phos-tag SDS-PAGEで解析したものです。
ArcBはG2 box (G470, G472)がATP 結合部位 です。
そこからH292にリン酸基を転移します。
Wt-ArcBでは,一種類のリン酸化バンド(H292~P)がみられます。
D576~PとH717~P 量が少ないために見えないと考えられます。
G2 boxをアラニンに置換したG2* ,リン酸化部位をアラニンに置換したH292Aでは
リン酸化が見られません。
また,G2*とH292A を当量混合した場合もリン酸化が見られません。
このことから,ArcB のH292リン酸化反応は(b)-(i)に示したように,
分子内転移であるとわかりました。

「ArcB/ArcA phosphorelay」 はArcBがATP存在下で自己リン酸化し,
そのリン酸基がArcB に転移する様子を解析しています。
WT-ArcBとArcA の組み合わせにおいて,
ArcAがリン酸化したものがシフトアップしていることから
リン酸基転移反応が起こったことが確認できました。

ArcB の3箇所のリン酸化部位をアラニン置換し,
できた3種類のmutantを組み合わせて3種類のペアを作り
それぞれ当量混合した時にリン酸化反応が起こるかどうか
(それぞれのmutant 単独では起こらない反応が相補されるかどうか)
を確かめたところ,(b)-(ii)(iiii)(iv)のように転移の機構がわかり,
結局,(c) の図のように,3段階の転移は,
cis-trans-transであることがわかりました。

ヒスチジンやアスパラギン酸のリン酸基は,化学的に不安定で,
特に酸性条件下で容易に加水分解されます。
アスパラギン酸のリン酸基はアルカリ性条件下でも容易に加水分解されます。
中性条件下でも,両者の半減期は,Ser/Thr/Tyrリン酸基よりもはるかに短いです。
そのため,解析方法が少なく,二成分伝達系の研究例は多くありません。
Phos-tag SDS-PAGEは,このような不安定なリン酸基の解析にも適しています。

 

関連画像

Sinorhizobium meliloti の 二成分伝達系 FixL/FixJのin vitro kinase assay
E.coli の二成分伝達系EvgS/EvgAのin vitro kinase assay -1

E.coli の二成分伝達系EvgS/EvgAのin vitro kinase assay -2
E.coli の二成分伝達系BarA/UvrYのin vitro kinase assay
E.coli の二成分伝達系PhoR/PhoBのin vitro kinase assay
E.coli のヒスチジンキナーゼEnvZのin vitro kinase assay

 

Reference

Kinoshita-Kikuta, E.,Kinoshita, E., Eguchi, Y., Koike, T.
Validation of Cis and Trans Modes in Multistep Phosphotransfer Signaling of Bacterial Tripartite Sensor Kinases by Using Phos-Tag SDS-PAGE.
PLOS One, 11(2): e0148294. (2015)

DOI:10.1371/journal.pone.0148294

ゲルの条件

Mn2+–Phos-tag: 20µM

Polyacrylamide: 8%(w/v)

検出方法 CBB stain

 


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